本校前身，牛津學堂(Oxford College)，為加拿大長老教會馬偕博士於1882年淡水現址創立。1959年「北部台灣基督長老教會」為繼承馬偕博士對台灣文化、教育、醫療的功勞與貢獻，決議於「牛津學堂」原址籌設大學。同年，台灣大學法學院商學系內部成立一個工商管理小組（Business Administration Group）做為設校推手。1965年8月教育部核准成立私立淡水工商管理專科學校(Tamsui Institute of Business Administration)，招收三年制及五年制專科學生。本校成為國內第一個以「Busniess Administration」為名提出設校的教育機構。本校成立之初，許多教授都來自台灣大學，他們為本校奠立了很重要的基礎。1994年8月奉教育部核准改制為四年制獨立學院，定名為私立淡水工商管理學院(Tamsui Oxford University College)。1999年改制為一般大學，校名為真理大學(Aletheia University)。

1999年：本校改制為一般大學，校名真理大學(Aletheia University)。整合工業管理學系、企業管理學系、資訊管理學系、管理科學研究所成立「管理學院」。整合數理統計與精算學系、數學系、資訊科學系「數理資訊學院」。

2001年：成立管理科學研究所在職碩士專班(EMBA)。

2003年：麻豆校區成立管科所知識經濟組與觀光組。

2006年: 數理統計與精算學系更名為統計與精算學系。

2007年: 成立資訊科學系碩士班。

2008年：設立皇冠海岸永續發展與服務創新研究中心。工業管理學系更名為工業管理與經營資訊學系。資訊科學系更名為資訊工程學系。

2009年：整併麻豆知識經濟學院，院名仍為管理學院。

2010年：管理科學研究所併入企業管理學系。成立企管系碩士班及在職碩士班。數學系更名為應用數學系。

2011年：設立創造力教育研究中心。

2015年: 統計與精算學系與應用數學系整併為財務與精算學系。數理資訊學院改名資訊與商業智慧學院。

2018年: 航空服務管理學系改名航空事業學系，隸屬於資訊與商業智慧學院。

2019年: 財務與精算學系更名為統計資訊與精算學系。

2021年: 管理學院、資訊與商業智慧學院，整併為管理與資訊學院。